Alors qu'ils sont à Central City, les deux frères Elric rencontrent leurs alliés, Roy Mustang alias l'alchimiste de feu, et le débonnaire Louis Armstrong. Ensemble, ils commencent leurs investigations tandis qu'un alchimiste est soupçonné de réaliser des expériences interdites sur des humains. Durant cette première enquête, ils affrontent leur grand rival Scar qui sème la panique dans la capitale.