Kazuya et Satellizer ont intégré l'académie Genetics pour combattre les Nova, des créatures venues d'une autre dimension. Les deux jeunes recrues vont traverser ensemble de nombreuses épreuves. Alors que Kazuya a été envoyé seul dans une autre dimension, il voit apparaître au coeur même de la bataille qui fait rage Satellizer et les filles de la 13^e section ! De l'issue de cet affrontement dépend l'avenir de la Terre comme du monde d'Elca. Kazuya réussira-t-il à percer le secret des Nova ?